Морские роботы активно применяются в гидрографии для автоматизации и повышения эффективности исследований акваторий. Их используют для гидрографических съёмок, обследования гидротехнических сооружений, трубопроводов, платформ, мониторинга водных путей, контроля дноуглубительных работ и поиска затонувших объектов. Аппараты позволяют работать в опасных или труднодоступных условиях (например, на критическом мелководье, в прибойной зоне, при сильных приливах и отливах), сокращают сроки и стоимость исследований, минимизируют риски для человека. 

Применение роботов в гидрографии отличается степенью автоматизации этого процесса - от их использования в режиме дистанционного управления до полностью автономных миссий с автоматическим сбором данных.